Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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