Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5640A3KG49 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5640A3KG49 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms