Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col9a3A2ACT7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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