Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms