Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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