Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms