Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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