Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn6Q9Z262 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn6Q9Z262 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn6Q9Z262 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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