Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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