Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psma1Q9R1P4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms