Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gpc6Q9R087 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gpc6Q9R087 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Gpc6Q9R087 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gpc6Q9R087 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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