Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fhl3Q9R059 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms