Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms