Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms