Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc4Q9QZD4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms