Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn8Q9QZ49 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms