Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms