Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l2Q9JLG4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms