Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nectin3Q9JLB9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms