Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms