Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tfr2Q9JKX3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tfr2Q9JKX3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tfr2Q9JKX3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tfr2Q9JKX3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tfr2Q9JKX3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tfr2Q9JKX3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tfr2Q9JKX3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tfr2Q9JKX3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tfr2Q9JKX3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tfr2Q9JKX3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tfr2Q9JKX3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfr2Q9JKX3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms