Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ybx3Q9JKB3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms