Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms