Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn2Q9ER65 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms