Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf6Q9DBU5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms