Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg9Q9DB90 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smg9Q9DB90 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms