Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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