Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc7Q9D541 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc7Q9D541 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms