Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrnp35Q9D384 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrnp35Q9D384 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms