Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms