Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc47Q9D024 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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