Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sgo1Q9CXH7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sgo1Q9CXH7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sgo1Q9CXH7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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