Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Malsu1Q9CWV0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms