Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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