Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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