Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg12Q9CQY1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg12Q9CQY1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms