Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms