Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms