Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms