Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms