Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ssxb1Q9CPU1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssxb1Q9CPU1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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