Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cox6cQ9CPQ1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms