Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms