Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NsmfQ99NF2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NsmfQ99NF2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NsmfQ99NF2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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