Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms