Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp16Q99LG0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms