Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prpf19Q99KP6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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