Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SmagpQ99KC7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SmagpQ99KC7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms