Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ctu1Q99J10 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctu1Q99J10 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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