Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms